内腸骨動脈は内腸骨動脈から分岐し、酸素化された血液を男性と女性の両方の外性器に送ります。ただし、性別により、解剖学的な違いがいくつかあります。
女性の動脈は小さくなる傾向があります。また、動脈の枝のいくつかは性別に固有です。男性では、この動脈の枝には陰茎の背側と深部動脈が含まれ、女性では陰核の背側と深部動脈があります。女性には後陰唇枝があり、男性には陰嚢枝があります。この動脈から生殖器に特有の他の血管もあります。
内陰部動脈から分岐する下直腸動脈と会陰動脈は、男女ともに同じです。